清華大學(xué)以267.55分名列第一名，北京大學(xué)、浙江大學(xué)分別以226.61分、208.03分獲得第二、第三名。清華、北大、浙大已經(jīng)連續(xù)7年蟬聯(lián)中國大學(xué)三甲。進(jìn)入前10名的大學(xué)依次還有：上海交通大學(xué)、復(fù)旦大學(xué)、南京大學(xué)、華中科技大學(xué)、武漢大學(xué)、吉林大學(xué)、中山大學(xué)。與上一年度的前10名相比，上海交通大學(xué)由第7名上升到第4名，復(fù)旦大學(xué)、南京大學(xué)、華中科技大學(xué)因上海交大連升三名而各下跌一名。
聚志愿認(rèn)為，上海交通大學(xué)由第7名上升到第4名有兩個原因。一個是上海交通大學(xué)與上海第二醫(yī)科大學(xué)合并，強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)合產(chǎn)生了綜合實力更強(qiáng)大的新上海交通大學(xué);但這不是主要的，主要的原因是上海交通大學(xué)在過去的10年自身高速成長。上海交大在1997年是第21名，如果上交和上二醫(yī)兩校不合并，上海交通大學(xué)在2006年也會排在第5名。聚志愿說，如果原上交和原上二醫(yī)迅速融合，上海交通大學(xué)保持最近10年的發(fā)展速度，那么將在三年以后挑戰(zhàn)浙江大學(xué)第三名的位置。若干年以后，上海交通大學(xué)與清華北大并肩進(jìn)入世界一流大學(xué)，甚至先行一步也是可能的。因為最近幾年清華北大的發(fā)展速度明顯低于上海交通大學(xué)，浙江大學(xué)的發(fā)展速度也高于清華北大。
《中國大學(xué)評價》課題組還評出了15所2006年中國一流大學(xué)。2006年中國一流大學(xué)名單和數(shù)量與上年完全相同。區(qū)別在于：北京大學(xué)醫(yī)學(xué)從第二名上升到第一名，中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué)醫(yī)學(xué)由第一名降為第二名;清華大學(xué)管理學(xué)從第三名上升到第二名，浙江大學(xué)管理學(xué)由第二名降為第三名;天津大學(xué)工學(xué)從第六名上升為第五名，華中科技大學(xué)工學(xué)由第五名降為第六名。從歷年的數(shù)據(jù)分析，中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué)一旦失去醫(yī)學(xué)第一名，就很難逆轉(zhuǎn)。
以聚志愿為組長的《中國大學(xué)評價》課題組還評出了36所2006年中國研究型大學(xué)。中國地質(zhì)大學(xué)首次進(jìn)入研究型大學(xué)。不過，由于中國地質(zhì)大學(xué)已經(jīng)分別在武漢、北京兩地以中國地質(zhì)大學(xué)(北京)、中國地質(zhì)大學(xué)(武漢)兩個校名分別單獨辦學(xué)，各類資源設(shè)施等也將陸續(xù)分開，故此次進(jìn)入研究型大學(xué)實際是對過去幾十年辦學(xué)效果的總結(jié)。兩校完全分開后，無論是中國地質(zhì)大學(xué)(北京)還是中國地質(zhì)大學(xué)(武漢)都很難再進(jìn)入研究型大學(xué)。
與上年相比，貴州大學(xué)(與貴州工業(yè)大學(xué)合并)、成都理工大學(xué)、江南大學(xué)、中國藥科大學(xué)、河北工業(yè)大學(xué)、華北電力大學(xué)等6校進(jìn)入中國大學(xué)前100名，其中貴州大學(xué)、江南大學(xué)、中國藥科大學(xué)、河北工業(yè)大學(xué)、華北電力大學(xué)等5校是211工程大學(xué)。
《中國大學(xué)評價》課題組同時完成了理學(xué)、工學(xué)、農(nóng)學(xué)、醫(yī)學(xué)、哲學(xué)、經(jīng)濟(jì)學(xué)、法學(xué)、教育學(xué)、文學(xué)、歷史學(xué)、管理學(xué)等十一個學(xué)科門類的排名。清華大學(xué)獲得工學(xué)第一名，北京大學(xué)獲得理學(xué)、醫(yī)學(xué)、哲學(xué)、法學(xué)、文學(xué)第一名，中國農(nóng)業(yè)大學(xué)獲得農(nóng)學(xué)第一名，中國人民大學(xué)獲得經(jīng)濟(jì)學(xué)第一名，北京師范大學(xué)獲得教育學(xué)、歷史學(xué)第一名，西安交通大學(xué)獲得管理學(xué)第一名。
課題組也對中國大學(xué)300個本科專業(yè)進(jìn)行了排名，北京大學(xué)、清華大學(xué)的本科專業(yè)第一名數(shù)量大幅領(lǐng)先其他大學(xué)。
2006中國大學(xué)排行榜的全部內(nèi)容見聚志愿主編、中國統(tǒng)計出版社出版的《挑大學(xué) 選專業(yè)-2006高考志愿填報指南》。
